MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015942	ATT	2	6	1894035	1894040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_015942	CTCA	2	8	1894092	1894099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_015942	AGC	2	6	1894225	1894230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_015942	CTG	2	6	1894249	1894254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_015942	GCA	2	6	1894261	1894266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015942	TG	3	6	1895262	1895267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015942	GTC	2	6	1895303	1895308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015942	ATT	2	6	1895335	1895340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015942	A	7	7	1895346	1895352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015942	TGT	2	6	1897953	1897958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015942	AC	4	8	1897960	1897967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_015942	TCCCC	2	10	1898357	1898366	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4513	NC_015942	TTG	2	6	1898480	1898485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015942	CG	3	6	1898527	1898532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_015942	A	6	6	1898546	1898551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015942	AAT	2	6	1898562	1898567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015942	CG	3	6	1898631	1898636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_015942	GTG	2	6	1898702	1898707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015942	ATG	2	6	1900482	1900487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015942	GCCGCT	2	12	1900555	1900566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_015942	GCCGCT	2	12	1900568	1900579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_015942	CGGT	2	8	1900603	1900610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_015942	ACCA	2	8	1900621	1900628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_015942	CACT	2	8	1900637	1900644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_015942	CTC	2	6	1900654	1900659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_015942	A	9	9	1900672	1900680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015942	AAT	2	6	1900699	1900704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015942	ACT	2	6	1900751	1900756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_015942	TAC	2	6	1900776	1900781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_015942	ACC	2	6	1900845	1900850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_015942	GCA	2	6	1900873	1900878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_015942	TTTG	2	8	1900888	1900895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015942	GCT	2	6	1900961	1900966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_015942	TGG	4	12	1901788	1901799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015942	CCGG	2	8	1901815	1901822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_015942	GATT	2	8	1902175	1902182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015942	TGCTT	2	10	1902199	1902208	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4538	NC_015942	GTAT	2	8	1902272	1902279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015942	GC	4	8	1902766	1902773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_015942	ACC	2	6	1902824	1902829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_015942	TCCTTT	2	12	1903285	1903296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015942	T	6	6	1903301	1903306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015942	TCC	2	6	1906078	1906083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_015942	CCG	2	6	1906110	1906115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_015942	TATC	2	8	1906123	1906130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_015942	GTAT	2	8	1906144	1906151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015942	ACAAA	2	10	1906201	1906210	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4548	NC_015942	A	7	7	1906230	1906236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015942	CCG	2	6	1906289	1906294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_015942	CAT	2	6	1909115	1909120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015942	CAA	2	6	1909188	1909193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_015942	TCT	2	6	1909293	1909298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015942	TA	5	10	1909299	1909308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015942	TTAT	3	12	1909327	1909338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015942	TAA	2	6	1909352	1909357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_015942	TTTA	2	8	1909432	1909439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015942	TGT	2	6	1909445	1909450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015942	T	6	6	1909475	1909480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015942	G	6	6	1909570	1909575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015942	T	6	6	1909580	1909585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015942	AT	3	6	1909629	1909634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015942	GTC	2	6	1909658	1909663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_015942	A	6	6	1909785	1909790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015942	GAA	2	6	1909802	1909807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015942	TC	3	6	1909830	1909835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_015942	TCCT	2	8	1910073	1910080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_015942	ATAA	2	8	1910093	1910100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015942	TA	3	6	1910154	1910159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015942	CGG	2	6	1910193	1910198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4572	NC_015942	ATT	2	6	1910700	1910705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4574	NC_015942	TC	3	6	1910837	1910842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_015942	AAC	2	6	1910853	1910858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_015942	AAC	2	6	1910906	1910911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_015942	GAA	2	6	1910945	1910950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_015942	TGGT	2	8	1910980	1910987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015942	GAT	2	6	1911120	1911125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015942	TGA	2	6	1911140	1911145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015942	CCCA	2	8	1911208	1911215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4583	NC_015942	CTC	2	6	1911905	1911910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_015942	GAT	2	6	1911993	1911998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015942	AATC	2	8	1912030	1912037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_015942	CTG	2	6	1912043	1912048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4588	NC_015942	GCCC	2	8	1912132	1912139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4589	NC_015942	TTG	2	6	1912758	1912763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_015942	TTTTC	3	15	1913824	1913838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4593	NC_015942	TA	3	6	1915400	1915405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_015942	GTTTT	3	15	1915420	1915434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015942	AG	3	6	1915467	1915472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4599	NC_015942	GTG	2	6	1917760	1917765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_015942	GCAACC	2	12	1917771	1917782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_015942	CACAA	2	10	1917787	1917796	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4602	NC_015942	CGG	2	6	1918193	1918198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015942	AGG	2	6	1919295	1919300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015942	AT	3	6	1920627	1920632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015942	TTTC	2	8	1920636	1920643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_015942	T	6	6	1920644	1920649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015942	CAAA	2	8	1925810	1925817	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_015942	A	9	9	1925815	1925823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015942	ACT	2	6	1925868	1925873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_015942	CAG	2	6	1927052	1927057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015942	TAAC	2	8	1927622	1927629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_015942	AGG	2	6	1927640	1927645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015942	AGC	2	6	1927705	1927710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_015942	AAC	2	6	1927713	1927718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015942	AC	3	6	1927717	1927722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_015942	AT	3	6	1928138	1928143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015942	A	8	8	1936319	1936326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015942	CCTT	2	8	1937456	1937463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_015942	T	6	6	1937470	1937475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015942	CA	3	6	1938251	1938256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_015942	ACA	2	6	1942850	1942855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_015942	CTG	2	6	1942891	1942896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_015942	AT	3	6	1942995	1943000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015942	AGC	2	6	1943001	1943006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_015942	TAC	2	6	1943012	1943017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_015942	T	8	8	1943059	1943066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015942	GCC	2	6	1943070	1943075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_015942	GCT	2	6	1943088	1943093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015942	TGCG	2	8	1943127	1943134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_015942	TGC	2	6	1943167	1943172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_015942	ATT	2	6	1943216	1943221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_015942	GCC	2	6	1944162	1944167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4766	NC_015942	AT	3	6	1996260	1996265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4767	NC_015942	TA	4	8	1996268	1996275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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